MicroLabVR: Interactive 3D Visualization of Simulated Spatiotemporal Microbiome Data in Virtual Reality
Simon Burbach, Maria Maleshkova, Florian Centler, Tanja Joan Schmidt
微生物群是人体的重要组成部分,从事食物消化和免疫防御等任务。 必须了解它们的结构和功能,以促进宿主健康并促进疾病期间的迅速恢复。 由于在原地实验研究这些系统的困难,在数学建模领域正在进行更多的研究。 可视化时空数据具有挑战性,目前模拟微生物群落时空发展的工具通常只提供有限的功能,通常需要专业知识才能产生有用的结果。 为了克服这些限制,我们提供了一个用户友好的工具,交互式地探索时空模拟数据,称为MicroLabVR,它将空间数据传输到虚拟现实(VR),同时遵循增强用户体验(UX)的指导方针。 使用MicroLabVR,用户可以导入包含人口增长、物质浓度发展和代谢通量分布数据的CSV数据集。 实现的可视化方法允许用户在VR环境中交互式地评估数据集。 MicroLabVR旨在通过在其空间环境中探索微生物组数据来改善用户的数据分析。
Microbiomes are a vital part of the human body, engaging in tasks like food digestion and immune defense. Their structure and function must be understood in order to promote host health and facilitate swift recovery during disease. Due to the difficulties in experimentally studying these systems in situ, more research is being conducted in the field of mathematical modeling. Visualizing spatiotemporal data is challenging, and current tools that simulate microbial communities' spatial and tempora...